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首頁 > 產(chǎn)品中心> 檢測試劑> DNA檢測> ThruPLEX® Plasma-seqRubiconGenomics 測序試劑盒
RubiconGenomics 測序試劑盒

簡要描述:RubiconGenomics ThruPLEX Plasma測序試劑盒
1、為無細胞DNA設(shè)計---新配制的修復(fù)和連接試劑。
2、高性能的NGS文庫---文庫多樣性,樣本輸入量少,有更寬的和可重復(fù)的GC覆蓋范圍。
3、適應(yīng)的樣本輸入量--<1-30mg的無細胞的DNA.
快速便捷的操作---在單個管或孔中,三步完成,2個小時,無需純化或者樣本轉(zhuǎn)移步驟。

  • 產(chǎn)品型號:ThruPLEX® Plasma-seq
  • 廠商性質(zhì):生產(chǎn)廠家
  • 更新時間:2023-07-31
  • 訪  問  量:3339
詳細介紹
品牌Corning/康寧產(chǎn)地類別進口
應(yīng)用領(lǐng)域醫(yī)療衛(wèi)生,生物產(chǎn)業(yè)

RubiconGenomics ThruPLEX Plasma測序試劑盒

ThruPLEX® Plasma-seq Kit

Illumina® NGS library preparation for cell-free DNA

用于無細胞DNA的Illumina NGS制備

RubiconGenomics ThruPLEX Plasma測序試劑盒

  1. 為無細胞DNA設(shè)計---新配制的修復(fù)和連接試劑。

  2. 高性能的NGS文庫---文庫多樣性,樣本輸入量少,有更寬的和可重復(fù)的GC覆蓋范圍。

  3. 適應(yīng)的樣本輸入量--<1-30mg的無細胞的DNA.

快速便捷的操作---在單個管或孔中,三步完成,2個小時,無需純化或者樣本轉(zhuǎn)移步驟。

美國Rubicon Genomics R30050   PicoPLEX:trademark: WGA kit    50 rxn  現(xiàn)貨供應(yīng)
美國Rubicon Genomics R400523 ThruPLEX DNA-seq 6S Kit 12 rxn  現(xiàn)貨供應(yīng)
美國Rubicon Genomics R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 12 rxn  現(xiàn)貨供應(yīng)

紅榮微再(上海)生物工程技術(shù)有限公司將一如既往的為您提供高品質(zhì)的:IPS/ES干細胞、試管嬰兒、再生醫(yī)學(xué)、細胞治療、組織器官再生、生物樣本處理、細胞培養(yǎng)等產(chǎn)品。


多樣性zui高,zui少的未映射的無細胞DNA讀取

優(yōu)秀的靶向序列捕獲Peformance

重現(xiàn)性好,無偏GC覆蓋

卡羅林斯卡研究所CRUK評估

ThruPLEX等離子-SEQ套件單管工作流程


多樣性zui高,zui少的未映射的無細胞DNA讀取


具有很高的多樣性和低數(shù)量的重復(fù)和未映射ThruPLEX等離子-SEQ套件產(chǎn)生質(zhì)量庫讀取。無細胞DNA從3血漿樣品中提取,并在如由Qubit®測定中所示的量制備的庫。 mononucleosomal的DNA各樣品中作為由Bioanalyzer®測量的量對應(yīng)于0.09納克,0.62納克,和15.44毫微克。匯集庫進行測序上的IlluminaNextSeq®500與17M 25M到一個配對末端運行每個庫讀取,復(fù)制計算率后的數(shù)據(jù)降采樣,以17米每庫讀取。


優(yōu)秀的靶向序列捕獲Peformance


ThruPLEX等離子體SEQ套件文庫以高效率捕獲并與激酶組用于突變檢測的深覆蓋所產(chǎn)生的數(shù)據(jù)。在5毫微克,6.5納克,一式三份10毫微克的操作量從3血漿樣品制備的庫,和有針對性的測序使用與ClearSeq人類DNA激酶組小組SureSelectXT2豐富的樣品進行了上Illumina的MiSeq。平均而言,5M分別讀取每個庫生成的。選擇的基地被成功抓獲那名中或毒餌250 bp的內(nèi)基地

美國Rubicon Genomics R30050   PicoPLEX:trademark: WGA kit    50 rxn  現(xiàn)貨供應(yīng)
美國Rubicon Genomics R400523 ThruPLEX DNA-seq 6S Kit 12 rxn  現(xiàn)貨供應(yīng)
美國Rubicon Genomics R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 12 rxn  現(xiàn)貨供應(yīng)

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重現(xiàn)性好,無偏GC覆蓋


ThruPLEX等離子-SEQ套件在整個人類基因組提供了zui可重復(fù)的和公正的GC覆蓋。 ThruPLEX庫顯示zui小變異橫跨9個人的血漿樣本進行測試。文庫從1毫升血漿樣品的分離和測序上的Illumina NextSeq 500四個單獨的血漿樣品無細胞的DNA制備的用于構(gòu)建NEBNext超庫。



卡羅林斯卡研究所CRUK評估


Illumina公司NGS庫用5納克使用ThruPLEX等離子體SEQ套件收集的血漿樣品中分離的無細胞的DNA的制備。低通WGS是在HiSeq進行大約12.5M每個庫的讀取。 (Karolinska研究所,瑞典的數(shù)據(jù)提供)。


ThruPLEX等離子-SEQ套件單管工作流程

ThruPLEX等離子-SEQ套件單管工作流程


1至30毫微克無細胞DNA的開始,ThruPLEX等離子-SEQ套件創(chuàng)建了3個簡單的步驟索引庫:末端修復(fù),接頭連接,以及高保真庫放大。不需要凈化或樣品轉(zhuǎn)移步驟。流線型的工作流程在2個小時的單管或表現(xiàn)良好,防止樣品的損失,提高陽性樣品鑒定。


ThruPLEX等離子-SEQ套件技術(shù)

ThruPLEX等離子-SEQ套件技術(shù)


ThruPLEX等離子體SEQ套件技術(shù)是為無細胞的DNA進行了優(yōu)化的3步反應(yīng)。無細胞的DNA(1ng至30毫微克)首先在一高效率的處理修復(fù)。背景是使用無單鏈尾雙鏈適配器減小。平端連接具有高效率的發(fā)生。阻止5'端減少適配器適配器連接。背景由結(jié)扎后破壞未使用的適配器進一步降低。高保真擴增完成反應(yīng),生成索引Illumina的圖書館。


Ordering Information

CAT. NO. R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S  Kit (12 reactions, 12 single indexes)

CAT. NO. R400491 ThruPLEX Plasma-seq 48S Kit (48 reactions, 48 single indexes)

CAT. NO. R400492 ThruPLEX Plasma-seq 96D Kit (96 reactions, 96 dual indexes)

美國Rubicon Genomics R30050   PicoPLEX:trademark: WGA kit    50 rxn  現(xiàn)貨供應(yīng)
美國Rubicon Genomics R400523 ThruPLEX DNA-seq 6S Kit 12 rxn  現(xiàn)貨供應(yīng)
美國Rubicon Genomics R400490 ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit 12 rxn  現(xiàn)貨供應(yīng)

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設(shè)計用于無細胞的DNA:新制定維修和連接試劑具有優(yōu)化的協(xié)議

高性能NGS庫:具有廣泛和可重復(fù)的GC覆蓋高度多樣性

可變采樣輸入:<1毫微克至30毫微克無細胞的DNA

快速簡單的工作流程:在單管3步,或同時在2個小時,沒有凈化或樣品轉(zhuǎn)移步驟

研究應(yīng)用:從庫樣本,其中結(jié)果需要高靈敏度,包括液體活檢,葉綠體DNA,并有針對性測序

自動化友好:Beckman®FXP工作站

在恒溫冷凍保證了9個月,在-20℃。


儲存于-20℃。


常見問題解答

1.什么類型的樣品和投入可以用等離子ThruPLEX-SEQ使用?

ThruPLEX等離子體SEQ套件被設(shè)計為從血漿中分離的無細胞的DNA產(chǎn)生的Illumina NGS DNA文庫。所述ThruPLEX等離子體SEQ化學(xué)被改寫,以產(chǎn)生多樣庫具有廣泛的GC覆蓋,從無細胞的DNA的1至30毫微克*提供重現(xiàn)的測序結(jié)果。

應(yīng)用程序的輸入樣本類型推薦的輸入量

從等離子和液體活檢DNA測序;葉綠體DNA分析,從血漿中1納克孤立的目標序列無細胞DNA - 30納克*

*庫已經(jīng)從輸入產(chǎn)生量低于1納克和超過30納克。

以獲取進一步的信息。

2.什么是ThruPLEX的DNA序列套件和新ThruPLEX等離子體序列包之間的主要技術(shù)差異?

ThruPLEX等離子體SEQ套件已經(jīng)用于從血漿中分離無細胞的DNA進行了優(yōu)化。

剪切或無細胞的DNA片段化是沒有必要與ThruPLEX等離子體以次套件。

的協(xié)議是不同的(見下文)。

3.什么是ThruPLEX等離子體序列和ThruPLEX的DNA序列之間的協(xié)議差異?

模板制備步驟:卷和保溫溫度

庫合成步驟:卷和孵化溫度

庫擴增步驟:卷和擴增循環(huán)數(shù)

4.可從血漿ThruPLEX-SEQ試劑與ThruPLEX的DNA序列試劑互換?

不,ThruPLEX等離子-SEQ套件內(nèi)容不與其他人Rubicon基因組學(xué)產(chǎn)品互換。

美國Rubicon Genomics R30050   PicoPLEX:trademark: WGA kit    50 rxn  現(xiàn)貨供應(yīng)
美國Rubicon Genomics R400523 ThruPLEX DNA-seq 6S Kit 12 rxn  現(xiàn)貨供應(yīng)
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5.什么索引類型或條形碼,你有可用?

ThruPLEX等離子體SEQ 12S和48S套件中提供的管分配Illumina的兼容8NT單個索引或96孔板中。這些指數(shù)序列是由威康信托基金會桑格研究所在英國劍橋的發(fā)展。關(guān)于桑格指數(shù)序列的信息可以在自然的方法可以找到7,111-118(2010)。

ThruPLEX等離子體SEQ 96D套件設(shè)置有Illumina公司TruSeq HT i5和在96孔板分配i7雙索引。在i5指標有Illumina的D501 D508到序列,和I7指標有D701到D712序列。

有關(guān)索引的詳細信息,請參閱附錄1的等離子ThruPLEX-SEQ套件說明手冊中的

6.你對隔離血漿中游離DNA有什么建議?

ThruPLEX等離子序列與游離DNA進行了優(yōu)化使用循環(huán)QIAamp®核酸試劑盒(Qiagen,目錄55114號)編制。

Tris和EDTA的在包含輸入DNA中的緩沖器中的濃度必須不超過10毫和0.1mM分別。避免含磷酸鹽緩沖液。

7.什么樣的收集管我應(yīng)該用從受試者抽血?

在盧比肯基因組學(xué)科研人員使用與K2 EDTA真空管靜脈管采集的血液(Becton Dickinson公司,貨號36643)。


9.從尿或其他生物液體隔離式CAN細胞游離DNA與ThruPLEX等離子-SEQ套件使用?

ThruPLEX等離子體以次用從人血漿中分離無細胞的DNA進行了優(yōu)化;然而,該試劑盒可以與來自其他生物流體降解的DNA的工作。從其它樣品來源無細胞的DNA必須首先用DNA提取/純化試劑盒提取。由于這些來源的游離DNA正常降解/零散,不成附加是不必要的。每個反應(yīng)輸入無細胞DNA的量必須不超過10微升。

10.與任何靶向序列捕獲系統(tǒng)兼容ThruPLEX等離子-SEQ套件?

是的,ThruPLEX等離子-SEQ套件與各大外顯子組和靶向富集產(chǎn)品,包括安捷倫SureSelect®,羅氏NimbleGen®SeqCap®EZ和自定義面板兼容。 

美國Rubicon Genomics R30050   PicoPLEX:trademark: WGA kit    50 rxn  現(xiàn)貨供應(yīng)
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